Presentaciķ i opcions | Caixa de diāleg de l'aplicaciķ |
Sintaxi |
En l'āmbit de l'ecologia, es defineix la connectivitat ecolōgica o terrestre com la capacitat que presenten els diferents hābitats que conformen un territori per permetre el moviment dels diversos organismes a través seu. La connectivitat es calcula a partir de la distribuciķ espacial i la caracteritzaciķ d'aquests hābitats. Si no es disposa de mapes d'hābitats també es pot calcular a partir de mapes de cobertes o d'usos del sōl.
Aquesta aplicaciķ genera una capa rāster que cobreix una determinada ārea d'estudi, en la qual cada celˇla conté l'Índex de Connectivitat Terrestre (ICT) per a aquell centre de celˇla, o punt focal, segons la fķrmula de Pino, modificada de la de Hanski.
ICT=Sumatori_de_l'ārea_de_les_celles_al_voltant_del_punt_focal
en quč:
l'ārea (A) de cada celˇla del voltant de cada punt focal es conserva si l'afinitat (a) amb la categoria focal és 1 i es va fent més petita com menor es aquesta afinitat. Alhora, l'ārea de cada celˇla del voltant també es fa més petita com més gran és la distāncia de la celˇla al punt focal i com més gran és la impedāncia, la qual s'utilitza en el cālcul de la distāncia de cost, δ. Una impedāncia molt gran fa que δ sigui gran i que la celˇla prācticament no contribueixi a la suma de l'ārea de connectivitat, mentre que una impedāncia mínima, igual a 1, fa que δ sigui la distāncia euclidiana i la contribuciķ a la suma de l'ārea sigui proporcional a l'exponencial negativa de la distāncia euclidiana; la contribuciķ de la impedāncia es multiplica per un valor α que proporciona una estimaciķ relacionada amb una dispersiķ mitjana de les espčcies en una situaciķ de mínima impedāncia i que s'estableix en una contribuciķ de 0.05 cops l'ārea a una distāncia igual al radi māxim d'exploraciķ: α= ln(0.05)/radi. En altres paraules, el 3r factor (funciķ exponencial) modula que la contribuciķ de l'ārea es multipliqui per 1 quan la distāncia sigui 0 i la impedāncia mínima, que es multipliqui per 0.05 quan la distāncia sigui el māxim radi d'exploraciķ i la impedāncia sigui també mínima (1), i que pugui multiplicar-se per prācticament zero quan la impedāncia sigui alta.
Per tal d'escalar adequadament els resultats, i tal i com es justifica més endavant, finalment s'aplica un logaritme en base 10 al resultat.
El cālcul s'efectua per a un cert hābitat o coberta/ús del sōl d'interčs, anomenat categoria focal, ICTc. Com s'explicarā posteriorment, és possible combinar els ICTc de les diferents categories per a obtenir un índex de connectivitat terrestre general, ICTg.
Essencialment l'ICT proporciona, en cada celˇla del rāster obtingut (o sigui, en cada punt focal), un indicador de l'ārea disponible (connectada) al seu voltant (fins a un radi māxim definit) per a una determinada categoria focal amb quč s'ha calculat aquell rāster. Per a fer el cālcul el programa suma les ārees (celˇles) al voltant de cada punt focal, perō ponderant-les en funciķ de la seva afinitat a la categoria focal (una categoria afí aporta més a la suma) i, alhora, ponderant l'ārea de cada celˇla en funciķ de la seva distāncia de cost al punt focal (aplicant un cost o "fricciķ" més gran que la pura distāncia geogrāfica segons la impedāncia de la categoria de la celˇla respecte de la categoria focal).
Per a obtenir l'Índex de Connectivitat Terrestre en cada punt focal i escriure'l a cada celˇla del rāster resultant aquesta aplicaciķ determina la seva connectivitat respecte d'una ārea circumdant a partir de:
La impedāncia es pot definir com la resistčncia a la connectivitat d'una categoria (un hābitat o una coberta/ús del sōl) respecte de la categoria focal.
El programa utilitza un fitxer rāster que proporciona, per a cada celˇla de l'ārea d'estudi (per exemple de 30 m de costat) la impedāncia amb la categoria focal objecte d'estudi. S'obté a partir d'una reclassificaciķ del fitxer d'hābitats o de cobertes/usos del sōl als valors adequats d'impedāncia de cada categoria respecte de la categoria focal. La impedāncia serveix per tal de considerar una distāncia no euclidiana entre els punts analitzats, sinķ modulada per un cost anisōtrop que evidentment existeix en considerar la connectivitat en un paisatge real, format per hābitats o cobertes diferents ubicats en diferents posicions al voltant de cada punt focal.
La impedāncia és mínima (1) entre la categoria focal i ella mateixa o entre ella i categories molt semblants. La impedāncia és māxima (per exemple 1000, valor que fa prācticament impossible la connectivitat) entre ella i altres categories en quč es consideri que la connectivitat és prācticament inexistent (entre boscos i zones urbanes, per exemple).
La impedāncia l'estableixen els experts en la connectivitat de cada hābitat/coberta/ús respecte dels altres hābitats/cobertes/usos. Sovint s'utilitza com a impedāncia l'invers de l'afinitat, descrita a continuaciķ.
Poden existir celˇles d'impedāncia etiquetades amb valors sensedades, que seran excloses del cālcul.
L'afinitat es pot definir com la similitud que presenta una categoria (un hābitat o una coberta/ús del sōl) respecte de la categoria focal, i que permet la connectivitat entre ambdues.
El programa utilitza un fitxer rāster que proporciona, per a cada celˇla de l'ārea d'estudi (per exemple de 30 m de costat) l'afinitat amb la categoria focal objecte d'estudi. L'afinitat s'obté a partir d'una reclassificaciķ del fitxer d'hābitats o de cobertes/usos del sōl als valors adequats d'afinitats de cada categoria respecte de la categoria focal.
L'afinitat és māxima (1) entre la categoria focal i ella mateixa o entre ella i categories molt semblants. L'afinitat és mínima (per exemple 0.001, valor que fa prācticament nulˇla la connectivitat) entre ella i altres categories en quč es consideri que l'afinitat és prācticament inexistent (entre boscos i zones urbanes, per exemple).
L'afinitat l'estableixen els experts en la connectivitat de cada hābitat/coberta/ús respecte dels altres hābitats/cobertes/usos. Una aproximaciķ és el nombre d'organismes compartits entre cada parella d'hābitats/cobertes/usos.
Poden existir celˇles d'afinitat etiquetades amb valors sensedades, que seran excloses del cālcul.
Com que els fitxers rāster d'impedāncia i d'afinitat es retallen iterativament, per aconseguir una māxima velocitat d'execuciķ, és preferible que siguin, o bé IMG sense comprimir (māxima velocitat de retall malgrat que ocupin més al disc) o bé fitxers extra-comprimits indexats (RLE indexat; des del GeM+ es pot comprovar aixō, o bé convertir-los a fitxers RLE indexats des de l'IMGIMG).
La persona usuāria ha de definir la distāncia de separaciķ entre punts focals o punts focals de referčncia per als quals es vol realitzar el cālcul de l'ICT. Aquesta distāncia s'expressa en les unitats del Sistema de Referčncia Horitzontal dels fitxers originals (d'impedāncies, etc). El fitxer rāster d'ICT tindrā com a costat de celˇla el mateix valor que la distāncia entre punts focals (o mostres) definida.
Normalment no és necessari (i seria molt lent) aplicar el cālcul a una distāncia entre punts focals igual al costat de celˇla dels mapes d'hābitats o de cobertes/usos originals, ja que les connectivitats calculades a una celˇla i a una celˇla adjacent sķn prācticament iguals. És per aixō que la distāncia entre punts focals sol ser un valor més gran que la de la celˇla original. A més, la distāncia entre punts focals ha de ser un valor que, dividit entre el costat de celˇla dels fitxers originals, doni un nombre senar (el programa controla aixō i emet un missatge d'error si no es compleix aquesta condiciķ). Per exemple, si es treballa amb un rāster amb costat de celˇla de 30 m, distāncies entre punts focals de 150 m, 210 m o 390 m poden ser valors adequats; valors progressivament més grans faran quadrāticament més rāpida l'execuciķ del programa o del BAT/PS1 resultant, perō cada cop menys precisa la determinaciķ de l'ICT; aquesta imprecisiķ es traduirā en més discontinuītats entre celˇles, perō sobretot en la possible no constataciķ d'ārees amb millor o pitjor connectivitat per causa d'un mostreig massa separat.
Es recomana fer algunes proves en una finestra de l'ārea d'estudi per tenir una percepciķ satisfactōria de quina distāncia entre punts focals és adequada en aquella zona, tenint en compte la seva estructura de paisatge i el costat de celˇla de quč es disposi en els mapes d'hābitats o de cobertes/usos. Cal tenir present que la fķrmula aplicada en cada punt focal suma les ārees de totes les celˇles veīnes (fins al radi indicat a continuaciķ) ponderades per l'afinitat amb la categoria focal i, alhora, ponderades per la distāncia de cost (anisōtropa, que considera la impedāncia) de cada celˇla al punt focal. Pel que fa a la influčncia en el temps de cālcul, es pot consultar el punt 1 dels aspectes avanįats.
La persona usuāria ha de definir el radi al voltant de cada punt focal en el qual es realitzarā el cālcul. A la prāctica, i per a accelerar els cālculs, en comptes d'aplicar un radi circular, s'utilitza una zona d'influčncia quadrada definida per un semicostat. Així doncs, el radi correspon al semicostat de les zones quadrades d'estudi i ha de ser un valor que, multiplicat per dos i dividit entre el costat de celˇla dels fitxers originals, doni un nombre senar. Si es treballa amb un costat de celˇla de 30 m, 2025 m pot ser un valor adequat; valors progressivament més grans faran quadrāticament més lenta l'execuciķ del programa o del BAT/PS1 resultant, perō amb un increment de precisiķ en la determinaciķ de l'ICT cada cop més petit atčs que l'exploraciķ en celˇles allunyades té poc pes en l'ICT final de les celˇles del rāster obtingut. Normalment aquest radi és un valor més gran que la distāncia entre punts focals, perō es tolera que pugui ser més petit per a propōsits exploratoris, per exemple per obtenir uns primers resultats més rāpidament (donat que un valor més petit del radi d'exploraciķ fa el cālcul més rāpid). Cal notar que com que l'efecte de la distāncia decreix exponencialment, fer un radi molt gran implicarā molt més temps de cālcul i els resultats seran prācticament iguals. Tanmateix, es pot consultar el punt 2 dels aspectes avanįats.
L'ICT obtingut es presentarā en un fitxer rāster que expressa en cada celˇla el logaritme en base 10 de la superfície de connectivitat de la celˇla (sumant 1 a la superfície per evitar valors negatius del logaritme). S'aplica un logaritme per a tenir uns rangs de valors adequats en el mapa (d'una banda l'índex així calculat té valors més petits i, alhora, els valors més grans perō més diferents queden més propers, mentre que és possible distingir millor els valors de connectivitats baixes i mitjanes).
Aquest fitxer rāster tindrā un costat de celˇla igual la distāncia entre punts focals indicada per la persona usuāria.
L'aplicaciķ permet triar les unitats del fitxer ICT, ja sigui en hectārees (ha) sumant 1 al valor pels motius expressats prèviament, o en m˛ (+1) si així es desitja (opciķ que pot ser més convenient si es treballa en distāncies curtes on la consideraciķ "per m˛" pugui resultar més natural que la consideraciķ "per ha"). Per claredat en l'expressiķ de les unitats, al fitxer de sortida s'indica log(ha) o log(m˛), tot i que en realitat el que es calcula és log10(ha+1) o log10(m˛+1).
Com també s'ha dit, típicament es vol obtenir un fitxer ICTc per a cada hābitat o coberta/ús d'interčs (boscos, conreus, etc), a través de sengles execucions d'aquest programa. Posteriorment, es pot obtenir un ICT general fent una mitjana dels diferents rāsters (ICTc, per ICT de cada coberta) amb l'aplicaciķ EstRas (o amb el CalcImg). Aquesta mitjana és una aproximaciķ que pondera per igual els diferents hābitats o cobertes; es pot valorar fer una mitjana ponderada en funciķ de la proporciķ de cada coberta a cada celˇla com a aproximaciķ més territorial. També es pot densificar qualsevol d'aquests fitxers resultants a la resoluciķ del mapa d'hābitats o de cobertes/usos original; se suggereix fer-ho amb l'aplicaciķ DensRas seleccionant interpolaciķ bilineal.
Si es vol revertir el valor de l'índex a la dada de superfície (en ha o en m˛, segons com s'hagi calculat) de connectivitat de cada celˇla, simplement cal efectuar, amb la funciķ POW() de l'aplicaciķ CalcImg, l'operaciķ: capa_superficie=10(capa_ICT)-1.
Si es desitja tenir una capa de punts estructurats (.pnt, vectorial) amb l'ICT de cada punt focal excloent les celˇles que eventualment puguin estar en zones sensedades (mar, etc), es pot executar l'aplicaciķ IMGPNT; cal notar que si es disposa dels diferents ICT dels diversos hābitats o cobertes de la zona d'estudi configurats com un rāster multibanda, l'IMGPNT permet obtenir el .pnt en una sola operaciķ, que crearā tants camps en la taula d'atributs del fitxer .pnt com bandes contingui el rāster multibanda.
Optativament, és possible indicar que es vol generar dues capes addicionals, una amb punts centrats a cada punt focal i una amb polígons delimitant la zona analitzada en cada punt focal. Aquestes capes no intervenen directament en el procés de cālcul, perō poden ser útils per a tenir una idea més visual de la densitat del mostreig i l'abast geogrāfic de cada punt, quelcom útil en docčncia, per exemple. Aquests fitxers tindran el mateix nom que el rāster ICTc generat, perō afegint-hi els sufixos "_Mostres" i "_Zones", respectivament. Els atributs dels punts i els polígons aniran des d'1 al nombre de punts focals (o mostres) analitzades. Aquests fitxers seran vectors no estructurats (.vec); si el nombre de punts focals és molt gran, el seu dibuixat, consulta, etc, serā lent, per la qual cosa pot ser convenient convertir-los a fitxers estructurats (.pnt i .pol) a través de les aplicacions VECPNT i Ciclar del MiraMon indicant (important!) que NO es desitja estructuraciķ topolōgica.
En āmbits extensos (milers de km˛) amb distāncies de mostreig curtes (centenars de metres) i radis d'exploraciķ llargs (quilōmetres) els temps d'execuciķ poden requerir moltes hores, o dies. És per aixō que l'aplicaciķ permet (amb els parāmetres FilaIni, FilaFi i NFaixa) preparar diferents rāsters de sortida o diferents fitxers BAT/PS1 de sortida per a poder paralˇlelitzar l'execuciķ en diferents ordinadors o en ordinadors amb diferents nuclis.
Aspectes avanįats.
nou_temps=temps_referencia*(dist_temps_referencia/nova_dist)˛
Per exemple, en el cas anterior, el nou temps serā 1.5*(390/150)˛=10.14 h. Cal notar, doncs, que encara que la relaciķ de millora de resoluciķ en termes de costat de celˇla és de "només" 2.6 vegades, el temps es multiplica per 6.76 (el quadrat de la relaciķ entre els costats).
![]() |
Caixa de diāleg de l'ICT |